Para essas versões, os visuais e jogabilidades do jogo foram alteradas um pouco para adequar com o aparelho, com uma interface de tela sensível ao toque, que permite o jogador selecionar comandos e mover o personagem com o dedo.
Pela versão do Vita terá o crossplay, onde os jogadores serão capazes de conectar com seus amigos no PC, podendo que usuários de ambos sistemas joguem juntos. A tela sensível ao toque, pode ser usada para conversar pelo o teclado virtual. O canto inferior direito da tela tem os ícones dos botões de ataque e das photon arts.
A versão Android e iPhone se chama Phantasy Star Online 2 es. A diferença pelo nome está no fato do jogo não suportar o modo multiplayer, entretanto de alguma forma será usada em conjunto com as versões para PC / Vita.
Nessa versão não muda muito em relação ao Vita, por também ter os controles compatível com a tela sensível ao toque. Usando os dedos você poderá desviar seu personagem dos ataques dos inimigos, pegar itens e executar outros movimentos diferentes tocando ou passando o dedo na tela.
As versões Mobile serão as primeiras a lançar ainda este ano no Japão, seguido pelo PlayStation Vita no início do próximo ano. A partir daí, todas as versões do PSO2 virão ao Ocidente ao longo de 2013.